Действие этого захватывающего аниме разворачивается в мире, окутанном загадками. Из-за резкого изменения климата, большая часть планеты была затоплена огромными объемами воды. Главный герой Икаруга Нацуки стал одним из тех несчастных, кто потерял дорогих ему людей и даже свою ногу вследствие последствий этой катастрофы. Проживая на своей подводной лодке с огромными долгами от своей бабушки-океанолога, Нацуки решает отправиться на поиски затонувших руин лаборатории, где работала его бабушка. Там же по легендам находится ценное сокровище - ключ к раскрытию множества тайн. Однако то, что он обнаружил в недрах океана превзошло все его ожидания. Вдали от шумного мегаполиса, Нацуки обнаружил загадочную Атри - спящую в гробнице девушку-робота. Пробуждение Атри стало для Нацуки неожиданным открытием, и он решает помочь ей найти свой путь. В благодарность за спасение, Атри обещает помогать Нацуки в его поисках до тех пор, пока она не выполнит свою последнюю миссию. Несмотря на то, что они так разные - человек и робот, между Нацуки и Атри завязывается необычная дружба. Вместе они отправляются на незабываемое приключение, полное загадок и опасностей. Их лето наполнено смелыми открытиями и эпическими битвами под водой. В этом удивительном морском городке, где время движется медленно под водой, Нацуки и Атри находят ответы на свои самые туманные вопросы. Они узнают друг друга лучше всего - как друзей и союзников со странными судьбами. Полны оптимизма и решимости принять любые испытания, эта пара будет продолжать направляться к новому будущему - светлому или темному - неважно для них.