Кобато - милая и добрая девушка, которая отправляется на Землю с одной целью - исполнить своё заветное желание. Но её путь не будет легким, ведь она придётся исцелять людей и наполнять волшебную бутылочку "осколками" их страданий. Иорёги, могущественное магическое существо в образе синего плюшевого пса, становится проводником и куратором Кобато в этом незнакомом мире людей. Несмотря на то, что Кобато хорошо подготовлена к своей миссии благодаря знаниям из манги, оказывается, что она не имеет представления о жизни людей. Её никогда не учили как вести себя с ними или какие чувства проявлять. Это приводит её в затруднительное положение, но она не отчаивается и продолжает помогать людям по-своему. Кобато быстро завоевывает сердца всех тех, кому помогает. Её доброта и сострадание заставляют людей поверить в чудеса, а её искренность в стремлении помогать безвозмездно вызывает неподдельное восхищение. Таким образом, она не только исполняет своё желание, но и становится союзницей людей в борьбе против страданий. Однако Кобато сама не может позволить себе проявлять чувства к тем, чьи сердца она исцеляет. Она понимает, что её миссия на Земле заключается в помощи другим и делает всё возможное для этого. Несмотря на свою наивность и некоторые странности, Кобато доказывает, что даже самое простое сердце может иметь большую силу и способно изменить мир к лучшему.