И действительно, с тех пор как последняя битва с фестумами закончилась, прошло уже два года. На острове Тацумия мирно плыла жизнь и все постепенно возвращались к своим обычным заботам. Но для Кадзуки Макабэ, героя последней войны, жизнь перестала быть такой радостной. Ослепление лишило его чувства надежды и веры в то, что Соси Минасиро вернется и всё снова станет как раньше. Однако всё меняется одной ночью, когда на берегу острова появляется подводная лодка с неизвестными людьми на борту. Из морского транспорта выходит юноша по имени Мисао Курусу, утверждающий, что он послан самим Соси Минасиро. Это заявление разжигает новую вражду между фестумами и людьми. С этого момента пилотам фафниров приходится вновь обратиться к своим навыкам и столкнуться со старым противником. Но на этот раз это не просто еще одна битва, это самая важная из всех. От ее исхода будет зависеть будущее человечества и фестумов. Кадзуки навсегда изменится после этой схватки, узнав о тайнах своего прошлого и о том, кто на самом деле является его другом или врагом. И всё это происходит в мире, где решение одного человека может изменить судьбы многих. Но герои не собираются сдаваться - они пойдут до конца ради мира и будущего всех живых на земле. Последняя битва только начинается, и никто не знает какая цена будет заплачена за победу.
