В мире будущего, где человечество достигло невероятных высот в развитии технологий, биологические органы были полностью заменены на кибернетические импланты. Это открыло новые возможности для людей и стерло границу между человеком и машиной. Но такое совершенство получила не только наука - преступники также начали использовать передовые технологии для своих злодеяний. В ответ на это правительство Японии создало «Девятый отдел» - специальную полицейскую команду под руководством Дайсукэ Арамаки и Мотоко Кусанаги. Их задача - раскрыть самые опасные преступления, связанные с использованием кибер-технологий. Несмотря на то, что команда обычно успешно справляется со своими заданиями, все меняется, когда встречается с хакером Смеющимся человеком - недавно появившимся опасным преступником уровня А. Они начинают понимать, что эта игра в кошки-мышки может обернуться для них смертельной опасностью. Появляется шанс раскрыть самое грандиозное и сложное дело в своей карьере, следуя за хакером по разным уголкам Японии. Сможет ли команда «Девятого отдела» справиться с этой невероятно сложной задачей? Или Смеющийся человек останется неуловимым для них?