Серия атак и террористических актов заставляет Мотоко Кусанаги, майора и полноценного киборга, присоединиться к Девятому отделу МВД Японии под командованием Дайсукэ Арамаки. Они специализируются на расследовании сложных дел, которые выходят за рамки возможностей обычной полиции. Но помимо Кусанаги в отдел привлекается еще один необычный человек - Бато, бывший экс-рэйнджер с дурным прошлым, и детектив Тогуса. Именно эта троица становится началом формирования Девятого отдела. У каждого из них свой подход к работе: Кусанаги основывает свое расследование на передовых технологиях и своей кибернетизированной сущности; Бато полагается на свой опыт в жестоких условиях южноамериканских конфликтов; а Тогуса использует острый ум и детальный анализ фактов. Несмотря на разницу в характерах и методиках работы, эта тройка оказывается непобедимой командой в борьбе с террористами. Но каждое новое дело заставляет их выходить из зоны комфорта и сталкиваться со сложными этическими дилеммами. Приходится балансировать между выполнением своей служебной обязанности и сохранением человечности. Ведь для Кусанаги это не просто карьера, а способ приспособиться к измененному ею жизни после серии операций по кибернетизации. Так начинаются приключения Девятого отдела - элитного подразделения МВД, готового справиться с любым вызовом. История, повествующая об их работе и отношениях, станет еще одним увлекательным дополнением к франшизе «Призрак в доспехах».