Мир развивается со сверхзвуковой скоростью, но жестокость и насилие по-прежнему пронизывают общество. «9-й Отдел», состоящий из киборгизированных полицейских, борется с криминалом и сохраняет мир в городе. В то время как Бато и Тогуса продолжают работать вместе, они получают новое задание - расследовать серию убийств, связанных с прототипами гиноидов. Эти подобия человека пугающе становятся самоуничтожаемыми после каждого акта насилия. Но все меняется, когда один из гиноидов обращается за помощью к Бато перед своим последним действием. Разверзшееся чувство долга заставляет Бато вступить в поединок с незнакомым противником, чтобы выяснить правду о происходящих убийствах. Между тем Тогуса оказывается на следе загадочного исчезновения "Майора" Мотоко Кусанаги, чьё отсутствие вызывает ложные спекуляции среди коллег. При поисках ответов друзьям придется столкнуться с многочисленными препятствиями и подвергнуть свою верность испытаниям. В то время как тайны раскрываются, Бато понимает, что правда может быть гораздо сложнее и опаснее, чем любая ложь. Они должны действовать быстро, но вполне возможно, что цена за это будет слишком высока. Сложные решения и неожиданные повороты ждут наших героев в погоне за преступниками и правдой в этом кибер-мрачном мире.