В 2009 году человеческая раса оказалась втянутой в страшную межрасовую войну с названием "Макросс", которая стала их последней надеждой на спасение. Инопланетные цивилизации, зельтраны и мельтраны, боролись за контроль над вселенной, а люди пытались выжить в этом безумии. Именно во время одной из таких битв Хикару Итидзё, лётчик из Земного флота, спасает Линн Минмей - молодую и талантливую певицу. Но неожиданно для себя он обнаруживает, что они оба находятся на неисправном корабле зельтранов и больше нет шансов на спасение. Времени рассказывать друг другу свою жизнь не остается, поэтому Хикару и Минмей узнают друг друга только по имени. Но после успешного побега от зельтранов и возвращения на Макросс эта парочка становится неразлучными друзьями. Они проводят все свое время вместе: занимаются полетами, разговаривают о мечтах и будущем. Но вскоре Линн снова оказывается в опасности - зельтраны захватывают ее, а Хикару и его команде приходится бороться за свою жизнь. Когда все кажется потерянным, Мисоя Хаясэ, координатор Хикару и офицер на "Макросс", рассказывает ему о записи песни из далекого прошлого. Она говорит, что это может изменить ход войны и привести к мирному разрешению конфликта. Вместе со своей возлюбленной Минмей, которую он спас дважды, Хикару отправляется в опасное путешествие на Землю для поиска этой записи. Но что им предстоит увидеть там просто невозможно поверить - гибель цивилизации людей. И только благодаря мощной песне Минмей и поддержке своих верных друзей Хикару сможет препятствовать зельтранам в их стремлении к уничтожению Земли и обрести новую надежду на будущее.
