В самом далеком будущем, наступившем в 0093 году Вселенского Века, мир охватила война между Федерацией Земли и Нео-Зеоном. Главным образом эти силы были представлены двумя лидерами - Красной Кометой Чаром Азнаблем и пилотом Амуро Рэй, прозванным злейшим врагом Нео-Зеона. Долгие годы Чар скрывался от людей после окончания Одногодичной Войны, но теперь он вернулся и поднял флаг Нео-Зеона, чтобы напасть на Федерацию Земли. Его жажда мести и стремление к власти были неисчерпаемыми, и он был готов на все ради достижения своих целей. Но единственное препятствие на его пути стояло имя Амуро Рэй. Этот бесстрашный пилот Федерации Земли стал божественным героем после Одногодичной Войны и не хотел снова попадать под чары Красной Кометы. Они вели непримиримую борьбу, которая стала символом противостояния между Федерацией Земли и Нео-Зеоном. Но теперь судьба всего мира оказалась под угрозой. Нео-Зеон планировал разрушить Землю, направив на нее астероид «Ось». И только Амуро Рэй мог помешать этому зловещему плану. Он был готов выйти на бой с Красной Кометой и его армией, чтобы спасти человечество от неминуемого уничтожения. В самой жестокой и кровавой войне Вселенского Века два бывших врага превратились в смертельных врагов. Под предводительством Красной Кометы и Амуро Рэя началась последняя эпическая битва за будущее всего человечества. И только один из них останется на плаву после этого столкновения.
