Во время войны, которая длилась целый год, Герцогство Зион сражалось против Братства Мур. Не смотря на изначальное превосходство зионских войск, после серии битв они были вынуждены перейти на оборону. Когда мир наконец пришел, Герцогство превратилось в Республику и продолжил свое сопротивление. Один из самых опытных пилотов Республики - Дэрил - участвовал в заключительной битве под кодовым названием "Удар Молнии". Он пилотировал мобильного воина "Психо-Заку", который сыграл ключевую роль в уничтожении флота Братства Мур. Но вскоре после того, как "Психо-Заку" был потерян, Дэрил получает новое задание - отправиться на Землю для сбора информации о Альянсе Южных Морей. Тем временем, Ио - единственный пилот, который неоднократно противостоял Дэрилу в боях - получает шанс доказать свое мастерство и чувства верности к Республике. Он выбран для пилотирования прототипа мобильного воина "Атлас Гандам" и отправлен на Землю вместе с Дэрилом. Но когда два бывших врага вынуждены работать вместе, чтобы защитить свою Республику от Альянса Южных Морей, им придется найти способы преодолеть старую неприязнь и научиться доверять друг другу, чтобы выиграть эту новую смертельную битву. Сражаясь на чужой территории и сталкиваясь с разнообразными опасностями, Дэрил и Ио постепенно понимают, что они не такие разные как кажутся. В результате они обретают не только уверенность в своих способностях как пилоты мобильных воинов, но и ценное дружбу, которая может оказаться решающим фактором в этой жестокой борьбе за выживание Республики Зион.
